Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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