Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SHROOM2Q13796 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
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SHROOM2Q13796 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
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