Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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