Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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