Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms