Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
GOLGA3Q08378 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms