Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms