Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 CCDC152-202ENST00000388827 1237 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms