Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms