Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms