Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms