Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms