Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms