Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms