Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB25P57735 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB25P57735 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB25P57735 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB25P57735 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB25P57735 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB25P57735 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB25P57735 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB25P57735 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB25P57735 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB25P57735 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB25P57735 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB25P57735 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB25P57735 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB25P57735 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB25P57735 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB25P57735 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB25P57735 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB25P57735 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB25P57735 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB25P57735 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB25P57735 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB25P57735 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB25P57735 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB25P57735 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB25P57735 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB25P57735 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB25P57735 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB25P57735 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB25P57735 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB25P57735 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB25P57735 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB25P57735 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB25P57735 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB25P57735 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB25P57735 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB25P57735 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB25P57735 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB25P57735 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB25P57735 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB25P57735 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB25P57735 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB25P57735 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB25P57735 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB25P57735 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB25P57735 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB25P57735 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB25P57735 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB25P57735 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB25P57735 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB25P57735 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB25P57735 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB25P57735 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB25P57735 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB25P57735 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB25P57735 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB25P57735 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB25P57735 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB25P57735 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB25P57735 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB25P57735 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB25P57735 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB25P57735 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB25P57735 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB25P57735 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB25P57735 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB25P57735 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB25P57735 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB25P57735 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB25P57735 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB25P57735 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB25P57735 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB25P57735 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB25P57735 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB25P57735 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB25P57735 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB25P57735 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB25P57735 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB25P57735 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB25P57735 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB25P57735 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB25P57735 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB25P57735 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB25P57735 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB25P57735 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB25P57735 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB25P57735 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB25P57735 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB25P57735 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB25P57735 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB25P57735 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB25P57735 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB25P57735 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB25P57735 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB25P57735 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB25P57735 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB25P57735 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB25P57735 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB25P57735 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB25P57735 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms