Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF3P57682 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF3P57682 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF3P57682 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF3P57682 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF3P57682 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF3P57682 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF3P57682 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF3P57682 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF3P57682 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF3P57682 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF3P57682 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF3P57682 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF3P57682 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF3P57682 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF3P57682 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF3P57682 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF3P57682 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF3P57682 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF3P57682 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF3P57682 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF3P57682 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF3P57682 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF3P57682 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF3P57682 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF3P57682 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF3P57682 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF3P57682 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF3P57682 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF3P57682 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF3P57682 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF3P57682 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF3P57682 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF3P57682 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF3P57682 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF3P57682 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF3P57682 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF3P57682 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF3P57682 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF3P57682 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF3P57682 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF3P57682 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF3P57682 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF3P57682 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF3P57682 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF3P57682 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF3P57682 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF3P57682 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF3P57682 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF3P57682 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF3P57682 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF3P57682 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF3P57682 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF3P57682 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLF3P57682 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLF3P57682 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLF3P57682 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLF3P57682 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLF3P57682 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLF3P57682 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLF3P57682 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLF3P57682 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLF3P57682 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLF3P57682 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF3P57682 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF3P57682 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF3P57682 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF3P57682 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF3P57682 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF3P57682 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF3P57682 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF3P57682 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF3P57682 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF3P57682 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF3P57682 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF3P57682 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF3P57682 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF3P57682 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF3P57682 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF3P57682 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF3P57682 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF3P57682 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF3P57682 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF3P57682 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF3P57682 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF3P57682 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF3P57682 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF3P57682 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF3P57682 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF3P57682 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF3P57682 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF3P57682 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF3P57682 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF3P57682 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF3P57682 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF3P57682 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF3P57682 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF3P57682 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF3P57682 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF3P57682 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms