Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME5P56597 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME5P56597 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NME5P56597 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME5P56597 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME5P56597 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME5P56597 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME5P56597 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME5P56597 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME5P56597 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME5P56597 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME5P56597 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME5P56597 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME5P56597 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME5P56597 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME5P56597 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME5P56597 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME5P56597 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME5P56597 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME5P56597 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME5P56597 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME5P56597 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME5P56597 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME5P56597 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME5P56597 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME5P56597 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME5P56597 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME5P56597 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME5P56597 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME5P56597 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME5P56597 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME5P56597 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME5P56597 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME5P56597 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME5P56597 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME5P56597 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME5P56597 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME5P56597 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME5P56597 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME5P56597 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME5P56597 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME5P56597 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME5P56597 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME5P56597 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME5P56597 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME5P56597 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME5P56597 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME5P56597 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME5P56597 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME5P56597 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME5P56597 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME5P56597 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME5P56597 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME5P56597 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME5P56597 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME5P56597 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME5P56597 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME5P56597 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME5P56597 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME5P56597 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME5P56597 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NME5P56597 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME5P56597 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME5P56597 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME5P56597 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NME5P56597 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME5P56597 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME5P56597 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME5P56597 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME5P56597 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME5P56597 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME5P56597 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME5P56597 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME5P56597 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME5P56597 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME5P56597 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME5P56597 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms