Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms