Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms