Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIP4K2AP48426 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms