Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRPPRCP42704 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRPPRCP42704 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms