Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GGCXP38435 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GGCXP38435 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GGCXP38435 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GGCXP38435 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GGCXP38435 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GGCXP38435 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GGCXP38435 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GGCXP38435 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GGCXP38435 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GGCXP38435 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GGCXP38435 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GGCXP38435 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GGCXP38435 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GGCXP38435 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GGCXP38435 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GGCXP38435 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GGCXP38435 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GGCXP38435 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GGCXP38435 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GGCXP38435 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GGCXP38435 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GGCXP38435 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GGCXP38435 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GGCXP38435 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GGCXP38435 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GGCXP38435 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GGCXP38435 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GGCXP38435 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GGCXP38435 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GGCXP38435 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GGCXP38435 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GGCXP38435 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GGCXP38435 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GGCXP38435 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GGCXP38435 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GGCXP38435 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GGCXP38435 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GGCXP38435 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GGCXP38435 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GGCXP38435 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GGCXP38435 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GGCXP38435 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GGCXP38435 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GGCXP38435 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GGCXP38435 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GGCXP38435 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GGCXP38435 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GGCXP38435 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GGCXP38435 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGCXP38435 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGCXP38435 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGCXP38435 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGCXP38435 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGCXP38435 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGCXP38435 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGCXP38435 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGCXP38435 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGCXP38435 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGCXP38435 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGCXP38435 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGCXP38435 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGCXP38435 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGCXP38435 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGCXP38435 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGCXP38435 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGCXP38435 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGCXP38435 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGCXP38435 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GGCXP38435 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGCXP38435 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGCXP38435 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGCXP38435 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGCXP38435 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGCXP38435 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGCXP38435 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGCXP38435 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGCXP38435 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGCXP38435 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GGCXP38435 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGCXP38435 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGCXP38435 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGCXP38435 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGCXP38435 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGCXP38435 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGCXP38435 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGCXP38435 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGCXP38435 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGCXP38435 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGCXP38435 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGCXP38435 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GGCXP38435 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGCXP38435 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGCXP38435 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGCXP38435 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGCXP38435 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGCXP38435 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGCXP38435 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGCXP38435 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGCXP38435 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms