Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPS1P31327 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPS1P31327 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPS1P31327 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPS1P31327 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPS1P31327 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPS1P31327 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPS1P31327 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPS1P31327 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPS1P31327 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPS1P31327 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPS1P31327 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPS1P31327 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPS1P31327 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPS1P31327 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPS1P31327 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPS1P31327 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPS1P31327 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPS1P31327 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPS1P31327 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPS1P31327 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPS1P31327 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPS1P31327 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPS1P31327 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CPS1P31327 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPS1P31327 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CPS1P31327 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPS1P31327 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPS1P31327 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CPS1P31327 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPS1P31327 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPS1P31327 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPS1P31327 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPS1P31327 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPS1P31327 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPS1P31327 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPS1P31327 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPS1P31327 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPS1P31327 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPS1P31327 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CPS1P31327 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPS1P31327 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPS1P31327 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CPS1P31327 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPS1P31327 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CPS1P31327 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPS1P31327 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPS1P31327 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPS1P31327 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPS1P31327 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPS1P31327 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPS1P31327 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPS1P31327 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPS1P31327 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPS1P31327 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPS1P31327 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPS1P31327 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPS1P31327 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPS1P31327 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPS1P31327 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPS1P31327 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPS1P31327 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPS1P31327 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPS1P31327 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPS1P31327 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPS1P31327 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPS1P31327 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPS1P31327 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPS1P31327 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPS1P31327 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPS1P31327 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPS1P31327 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPS1P31327 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CPS1P31327 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPS1P31327 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPS1P31327 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPS1P31327 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPS1P31327 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPS1P31327 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPS1P31327 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CPS1P31327 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPS1P31327 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPS1P31327 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPS1P31327 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPS1P31327 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPS1P31327 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPS1P31327 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPS1P31327 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPS1P31327 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPS1P31327 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPS1P31327 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPS1P31327 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPS1P31327 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPS1P31327 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPS1P31327 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPS1P31327 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPS1P31327 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPS1P31327 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPS1P31327 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CPS1P31327 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms