Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms