Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms