Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLNP26678 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLNP26678 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PLNP26678 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PLNP26678 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PLNP26678 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PLNP26678 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PLNP26678 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PLNP26678 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PLNP26678 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PLNP26678 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PLNP26678 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PLNP26678 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PLNP26678 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PLNP26678 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PLNP26678 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PLNP26678 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PLNP26678 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PLNP26678 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PLNP26678 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PLNP26678 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PLNP26678 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PLNP26678 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PLNP26678 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PLNP26678 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PLNP26678 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PLNP26678 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PLNP26678 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PLNP26678 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PLNP26678 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PLNP26678 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PLNP26678 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PLNP26678 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms