Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCLP19338 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCLP19338 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCLP19338 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCLP19338 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NCLP19338 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCLP19338 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCLP19338 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCLP19338 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCLP19338 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCLP19338 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCLP19338 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCLP19338 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCLP19338 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCLP19338 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCLP19338 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCLP19338 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NCLP19338 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCLP19338 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCLP19338 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCLP19338 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCLP19338 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCLP19338 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCLP19338 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCLP19338 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCLP19338 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCLP19338 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCLP19338 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCLP19338 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCLP19338 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLP19338 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLP19338 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLP19338 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLP19338 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLP19338 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLP19338 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLP19338 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLP19338 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLP19338 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLP19338 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLP19338 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLP19338 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLP19338 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLP19338 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLP19338 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLP19338 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLP19338 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLP19338 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLP19338 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLP19338 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLP19338 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLP19338 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLP19338 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLP19338 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLP19338 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLP19338 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCLP19338 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCLP19338 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCLP19338 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCLP19338 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCLP19338 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCLP19338 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCLP19338 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCLP19338 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCLP19338 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCLP19338 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCLP19338 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCLP19338 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCLP19338 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCLP19338 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCLP19338 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCLP19338 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCLP19338 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCLP19338 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLP19338 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLP19338 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLP19338 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLP19338 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLP19338 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLP19338 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLP19338 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLP19338 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLP19338 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLP19338 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLP19338 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLP19338 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLP19338 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLP19338 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLP19338 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLP19338 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLP19338 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLP19338 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLP19338 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLP19338 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLP19338 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLP19338 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLP19338 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLP19338 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCLP19338 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCLP19338 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms