Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms