Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSPP15924 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSPP15924 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSPP15924 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSPP15924 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSPP15924 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSPP15924 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSPP15924 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSPP15924 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSPP15924 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSPP15924 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSPP15924 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSPP15924 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSPP15924 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSPP15924 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSPP15924 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSPP15924 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSPP15924 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DSPP15924 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSPP15924 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DSPP15924 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSPP15924 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSPP15924 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSPP15924 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSPP15924 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSPP15924 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSPP15924 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSPP15924 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSPP15924 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DSPP15924 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSPP15924 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DSPP15924 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSPP15924 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSPP15924 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSPP15924 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSPP15924 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSPP15924 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSPP15924 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSPP15924 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSPP15924 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DSPP15924 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSPP15924 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSPP15924 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSPP15924 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DSPP15924 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSPP15924 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSPP15924 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSPP15924 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSPP15924 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSPP15924 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DSPP15924 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSPP15924 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSPP15924 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSPP15924 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSPP15924 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSPP15924 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSPP15924 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSPP15924 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSPP15924 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSPP15924 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSPP15924 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSPP15924 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSPP15924 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSPP15924 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSPP15924 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms