Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGPD2P0DJD1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms