Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4AP0C0L4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms