Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms