Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCCAP05165 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PCCAP05165 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCCAP05165 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCCAP05165 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCCAP05165 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCCAP05165 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCCAP05165 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCCAP05165 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCCAP05165 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCCAP05165 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCCAP05165 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCCAP05165 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PCCAP05165 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCCAP05165 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCCAP05165 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCCAP05165 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCCAP05165 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCCAP05165 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCCAP05165 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCCAP05165 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PCCAP05165 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCCAP05165 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCCAP05165 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCCAP05165 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCCAP05165 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCCAP05165 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCCAP05165 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCCAP05165 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCCAP05165 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCCAP05165 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCCAP05165 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCCAP05165 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCCAP05165 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCCAP05165 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCCAP05165 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PCCAP05165 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCCAP05165 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCCAP05165 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCCAP05165 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCCAP05165 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCCAP05165 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCCAP05165 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCCAP05165 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCCAP05165 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCCAP05165 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCCAP05165 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCCAP05165 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCCAP05165 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCCAP05165 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCCAP05165 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCCAP05165 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCCAP05165 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCCAP05165 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCCAP05165 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCCAP05165 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCCAP05165 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCCAP05165 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PCCAP05165 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCCAP05165 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCCAP05165 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCCAP05165 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCCAP05165 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCCAP05165 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCCAP05165 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCCAP05165 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCCAP05165 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCCAP05165 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCCAP05165 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCCAP05165 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCCAP05165 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PCCAP05165 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCCAP05165 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCCAP05165 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PCCAP05165 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCCAP05165 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCCAP05165 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCCAP05165 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCCAP05165 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCCAP05165 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCCAP05165 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCCAP05165 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCCAP05165 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCCAP05165 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCCAP05165 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCCAP05165 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCCAP05165 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PCCAP05165 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCCAP05165 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCCAP05165 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCCAP05165 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCCAP05165 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCCAP05165 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCCAP05165 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCCAP05165 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCCAP05165 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCCAP05165 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PCCAP05165 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCCAP05165 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCCAP05165 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms