Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTA1P02549 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms