Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms