Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRMUO75648 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRMUO75648 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRMUO75648 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRMUO75648 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRMUO75648 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRMUO75648 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRMUO75648 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRMUO75648 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRMUO75648 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRMUO75648 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRMUO75648 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRMUO75648 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRMUO75648 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRMUO75648 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRMUO75648 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRMUO75648 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRMUO75648 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRMUO75648 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRMUO75648 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRMUO75648 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRMUO75648 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRMUO75648 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRMUO75648 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRMUO75648 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TRMUO75648 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRMUO75648 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRMUO75648 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRMUO75648 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRMUO75648 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRMUO75648 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRMUO75648 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRMUO75648 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRMUO75648 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRMUO75648 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRMUO75648 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRMUO75648 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRMUO75648 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRMUO75648 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRMUO75648 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRMUO75648 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRMUO75648 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRMUO75648 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRMUO75648 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRMUO75648 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRMUO75648 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRMUO75648 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRMUO75648 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRMUO75648 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRMUO75648 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRMUO75648 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRMUO75648 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRMUO75648 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRMUO75648 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRMUO75648 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRMUO75648 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRMUO75648 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRMUO75648 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRMUO75648 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRMUO75648 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRMUO75648 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRMUO75648 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRMUO75648 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRMUO75648 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRMUO75648 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRMUO75648 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRMUO75648 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRMUO75648 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRMUO75648 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRMUO75648 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRMUO75648 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRMUO75648 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRMUO75648 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRMUO75648 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRMUO75648 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRMUO75648 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRMUO75648 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRMUO75648 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRMUO75648 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRMUO75648 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRMUO75648 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRMUO75648 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRMUO75648 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRMUO75648 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRMUO75648 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRMUO75648 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRMUO75648 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRMUO75648 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRMUO75648 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRMUO75648 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRMUO75648 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRMUO75648 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRMUO75648 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRMUO75648 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRMUO75648 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRMUO75648 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRMUO75648 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRMUO75648 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRMUO75648 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRMUO75648 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms