Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG13O75143 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG13O75143 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG13O75143 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG13O75143 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG13O75143 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG13O75143 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG13O75143 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG13O75143 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG13O75143 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG13O75143 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG13O75143 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG13O75143 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG13O75143 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG13O75143 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG13O75143 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG13O75143 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG13O75143 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG13O75143 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG13O75143 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG13O75143 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG13O75143 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG13O75143 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG13O75143 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG13O75143 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG13O75143 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG13O75143 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG13O75143 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG13O75143 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG13O75143 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG13O75143 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG13O75143 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG13O75143 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG13O75143 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG13O75143 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG13O75143 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG13O75143 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG13O75143 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG13O75143 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG13O75143 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG13O75143 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG13O75143 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG13O75143 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG13O75143 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG13O75143 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG13O75143 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG13O75143 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG13O75143 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG13O75143 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG13O75143 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG13O75143 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG13O75143 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG13O75143 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG13O75143 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG13O75143 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG13O75143 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG13O75143 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG13O75143 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG13O75143 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG13O75143 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG13O75143 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG13O75143 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG13O75143 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG13O75143 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG13O75143 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG13O75143 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG13O75143 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG13O75143 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG13O75143 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG13O75143 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG13O75143 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG13O75143 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG13O75143 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG13O75143 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG13O75143 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG13O75143 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG13O75143 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG13O75143 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG13O75143 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG13O75143 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG13O75143 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG13O75143 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG13O75143 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG13O75143 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG13O75143 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG13O75143 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG13O75143 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG13O75143 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG13O75143 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG13O75143 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG13O75143 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG13O75143 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG13O75143 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG13O75143 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG13O75143 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG13O75143 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG13O75143 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG13O75143 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG13O75143 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG13O75143 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms