Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSVO60911 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSVO60911 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSVO60911 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSVO60911 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSVO60911 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSVO60911 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSVO60911 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSVO60911 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSVO60911 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSVO60911 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSVO60911 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSVO60911 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSVO60911 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSVO60911 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSVO60911 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSVO60911 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSVO60911 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSVO60911 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSVO60911 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSVO60911 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSVO60911 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSVO60911 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSVO60911 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSVO60911 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSVO60911 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSVO60911 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSVO60911 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSVO60911 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSVO60911 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSVO60911 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSVO60911 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSVO60911 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSVO60911 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSVO60911 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSVO60911 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSVO60911 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSVO60911 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSVO60911 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSVO60911 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSVO60911 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSVO60911 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSVO60911 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSVO60911 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSVO60911 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSVO60911 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSVO60911 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSVO60911 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSVO60911 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSVO60911 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSVO60911 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSVO60911 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSVO60911 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSVO60911 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSVO60911 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSVO60911 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSVO60911 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSVO60911 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSVO60911 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSVO60911 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSVO60911 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSVO60911 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSVO60911 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSVO60911 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSVO60911 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSVO60911 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSVO60911 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSVO60911 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSVO60911 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSVO60911 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSVO60911 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSVO60911 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSVO60911 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSVO60911 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSVO60911 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSVO60911 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSVO60911 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSVO60911 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSVO60911 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSVO60911 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSVO60911 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSVO60911 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSVO60911 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSVO60911 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSVO60911 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSVO60911 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSVO60911 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSVO60911 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSVO60911 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSVO60911 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSVO60911 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSVO60911 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSVO60911 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSVO60911 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSVO60911 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSVO60911 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSVO60911 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSVO60911 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSVO60911 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSVO60911 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms