Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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VEGFDO43915 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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VEGFDO43915 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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VEGFDO43915 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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VEGFDO43915 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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VEGFDO43915 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VEGFDO43915 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
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VEGFDO43915 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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VEGFDO43915 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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VEGFDO43915 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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