Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGTAO43765 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGTAO43765 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGTAO43765 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SGTAO43765 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGTAO43765 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGTAO43765 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGTAO43765 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGTAO43765 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGTAO43765 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGTAO43765 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGTAO43765 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGTAO43765 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGTAO43765 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGTAO43765 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGTAO43765 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGTAO43765 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGTAO43765 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGTAO43765 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGTAO43765 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGTAO43765 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGTAO43765 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGTAO43765 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGTAO43765 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGTAO43765 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGTAO43765 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGTAO43765 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SGTAO43765 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGTAO43765 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGTAO43765 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGTAO43765 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGTAO43765 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGTAO43765 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGTAO43765 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGTAO43765 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGTAO43765 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGTAO43765 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGTAO43765 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGTAO43765 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGTAO43765 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGTAO43765 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGTAO43765 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGTAO43765 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGTAO43765 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGTAO43765 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGTAO43765 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGTAO43765 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGTAO43765 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGTAO43765 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGTAO43765 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGTAO43765 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGTAO43765 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGTAO43765 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGTAO43765 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGTAO43765 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGTAO43765 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGTAO43765 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SGTAO43765 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGTAO43765 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGTAO43765 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGTAO43765 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGTAO43765 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGTAO43765 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGTAO43765 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGTAO43765 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGTAO43765 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGTAO43765 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGTAO43765 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGTAO43765 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGTAO43765 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGTAO43765 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGTAO43765 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGTAO43765 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGTAO43765 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGTAO43765 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGTAO43765 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGTAO43765 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGTAO43765 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGTAO43765 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGTAO43765 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SGTAO43765 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGTAO43765 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGTAO43765 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGTAO43765 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGTAO43765 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGTAO43765 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGTAO43765 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGTAO43765 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGTAO43765 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGTAO43765 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGTAO43765 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGTAO43765 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGTAO43765 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGTAO43765 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGTAO43765 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGTAO43765 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGTAO43765 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGTAO43765 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SGTAO43765 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGTAO43765 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms