Protein–RNA interactions for Protein: O43166

SIPA1L1, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L1O43166 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIPA1L1O43166 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L1O43166 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms