Protein–RNA interactions for Protein: O00267

SUPT5H, Transcription elongation factor SPT5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT5HO00267 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SUPT5HO00267 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SUPT5HO00267 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
SUPT5HO00267 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SUPT5HO00267 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC33.82■■■■□ 3
SUPT5HO00267 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3
SUPT5HO00267 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SUPT5HO00267 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
SUPT5HO00267 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SUPT5HO00267 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SUPT5HO00267 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
SUPT5HO00267 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SUPT5HO00267 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SUPT5HO00267 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SUPT5HO00267 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SUPT5HO00267 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SUPT5HO00267 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC33.81■■■■□ 3
SUPT5HO00267 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SUPT5HO00267 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SUPT5HO00267 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC33.81■■■■□ 3
SUPT5HO00267 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
SUPT5HO00267 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC33.81■■■■□ 3
SUPT5HO00267 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SUPT5HO00267 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
SUPT5HO00267 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SUPT5HO00267 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
SUPT5HO00267 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
SUPT5HO00267 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SUPT5HO00267 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SUPT5HO00267 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SUPT5HO00267 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SUPT5HO00267 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SUPT5HO00267 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SUPT5HO00267 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SUPT5HO00267 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SUPT5HO00267 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SUPT5HO00267 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SUPT5HO00267 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC33.8■■■■□ 3
SUPT5HO00267 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SUPT5HO00267 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SUPT5HO00267 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
SUPT5HO00267 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SUPT5HO00267 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SUPT5HO00267 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SUPT5HO00267 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
SUPT5HO00267 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC33.8■■■■□ 3
SUPT5HO00267 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SUPT5HO00267 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SUPT5HO00267 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SUPT5HO00267 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms