Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms