Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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