Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms