Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
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RABGEF1Q9UJ41 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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RABGEF1Q9UJ41 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
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RABGEF1Q9UJ41 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
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RABGEF1Q9UJ41 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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RABGEF1Q9UJ41 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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