Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ4

KRTAP9-2, Keratin-associated protein 9-2, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 MYLK-206ENST00000418370 7282 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 GABRB3-216ENST00000628124 5581 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 IKZF5-201ENST00000368886 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 OR6J1-201ENST00000540461 4165 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 MITF-203ENST00000328528 4680 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 CTNND1-205ENST00000399050 6313 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF260-202ENST00000523638 5666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 EYA1-202ENST00000340726 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 UBN2-201ENST00000473989 14444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 LY75-CD302-201ENST00000504764 5650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF45-206ENST00000615985 2912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC138915.4-201ENST00000565549 4147 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 DST-207ENST00000421834 18030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 PARP14-202ENST00000474629 7915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 SEMA5A-201ENST00000382496 11762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF555-201ENST00000334241 8557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF841-203ENST00000594295 3819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 CSMD1-206ENST00000520002 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 CSMD1-216ENST00000602557 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 CELF2-203ENST00000416382 6894 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 ATP2B1-204ENST00000428670 7032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 ADGRF5-202ENST00000283296 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 HOOK3-201ENST00000307602 14398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 NRXN1-206ENST00000402717 2508 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 PIK3AP1-203ENST00000371110 3151 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC11A2-203ENST00000394904 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 NEDD4L-204ENST00000382850 8251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 DDX24-209ENST00000621632 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 KCNH7-202ENST00000332142 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC7A2-203ENST00000470360 7638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.8 ms