Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC-0.34□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC-0.34□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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HMGN3Q15651 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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HMGN3Q15651 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
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HMGN3Q15651 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.39□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HMGN3Q15651 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
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