Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.5 ms