Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
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